Το κλίμα του Περού επηρεάζεται από πολλούς διαφορετικούς παράγοντες (ζούγκλα, Άνδεις, ρεύματα Χούμπολτ), παρουσιάζοντας τεράστια ποικιλομορφία μικροκλιμάτων που περιλαμβάνουν 28 από τους 32 κλιματικούς τύπους που συναντώνται παγκοσμίως.
Το κλίμα στην παράκτια ζώνη από τον Απρίλιο έως τον Σεπτέμβριο (χειμώνας) είναι η πιο κρύα περίοδος. Την περίοδο του καλοκαιριού, από Δεκέμβριο μέχρι Μάρτιο, την ημέρα κάνει ζέστη και ο ουρανός είναι καθαρός, όμως το βράδυ μπορεί να έχει ψύχρα. Οι βροχές είναι λίγες και δεν ξεπερνούν τα 150 χιλιοστά το χρόνο.
Το κλίμα των Άνδεων χαρακτηρίζεται από δύο χωριστές εποχές, την περίοδο των βροχών και την ξερή περίοδο. Η περίοδος των βροχών διαρκεί από τον Νοέμβριο μέχρι τον Μάρτιο, με συχνές και έντονες βροχοπτώσεις μικρής συνήθως διάρκειας, κυρίως τα απογεύματα. Η θερμοκρασία παρόλο που είναι καλοκαίρι δεν είναι ζεστή, λόγω του υψομέτρου.
Την στεγνή περίοδο έχει καθαρό ουρανό με δροσερές θερμοκρασίες.
Σε γενικές γραμμές καμία από τις εποχές του έτους δεν είναι απαγορευτική για να επισκεφθεί κανείς το Περού, με την κάθε περιοχή να έχει τα δικά της πλεονεκτήματα και μειονεκτήματα ανάλογα με την εποχή.